在很多大型組織中，主機代表著強大、安全、成本效益以及無以倫比的可靠性。然而，當一個應用的處理需求提升，或者響應時間沒有滿足用戶的預期，主機的成本往往會成為一個不利因素，這是因為MIPS/MSU需要提升，用戶不得不升級硬件;或者是因為系統變得過于復雜并且維護昂貴。保證主機環境是最新的、理解新的負載，企業才能避免服務器質量的下降、成本上漲以及計劃外的硬件升級。

　　主機所面臨的問題除了對于其成本高昂的一貫看法，也沒有足夠的學術機構支持主機的生存和發展。

　　對于大部分企業來說，在主機語言方面的人才不足是一個重要的問題，這也是過去十年中外包市場增長的主要驅動力。很多組織缺乏主機開發人員，并且認為大多數情況下是不必要并且極其昂貴的，所以考慮淘汰和替換主機，而采用現成的解決方案。

　　經過一項面向全球100多所大學主機編程語言(如COBOL)教育情況的調查，結果顯示主機教育還有很長的路要走。將近75%的大學并沒有將COBOL編程作為他們課程的一部分，即便是有71%的大學認為在未來十年或者更長時間里，企業還會依賴采用COBOL語言編程的應用——教育和企業需要的技能還有著很大的差距。

　　另外，更為廣泛的認知也是主機需要面對的大問題，雖然主機承載著很多企業的關鍵任務，但大多數情況下，它都是“隱形”的，除非是業務出現了中斷，否則很容易被遺忘。主機在提供著持續價值卻不為人知，這是制約主機發展的一個不利因素。

　　如今，主機產品還在不斷更新，如IBM投資了數十億美元在主機的研發上，而主機的性能價格比也在持續提升。最新的IBM zEC12主機能夠執行超過78000MIPS，相比上一代產品容量提升超過50%。對現代應用的理解、技術升級、持續的產品更新是主機賴以生存的重要因素，此外，不能忽視的是，主機還需要繼續加強用戶對其價值的認知。