Linux命令之sort的使用

sort +3 -4 All-Unigene_PlantTFFamily_Abstract.out >All-Unigene_PlantTFFamily_Abstract.sort

sort -k 4  All-Unigene_PlantTFFamily_Abstract.out >All-Unigene_PlantTFFamily_Abstract.sort1

 對一個文件兩列排序，一列正序一列逆序

sort -k1,1n -k2,2nr file

對一個文件兩列排序 

sort -k1,1n -k2,2n file
 

1 sort的工作原理

sort將文件的每一行作為一個單位，相互比較，比較原則是從首字符向后，依次按ASCII碼值進行比較，最后將他們按升序輸出。

[rocrocket@rocrocket programming]$ cat seq.txt
banana
apple
pear
orange
[rocrocket@rocrocket programming]$ sort seq.txt
apple
banana
orange
pear

2 sort的-u選項

它的作用很簡單，就是在輸出行中去除重復行。

[rocrocket@rocrocket programming]$ cat seq.txt
banana
apple
pear
orange
pear
[rocrocket@rocrocket programming]$ sort seq.txt
apple
banana
orange
pear
pear
[rocrocket@rocrocket programming]$ sort -u seq.txt
apple
banana
orange
pear

pear由于重復被-u選項無情的刪除了。

3 sort的-r選項

sort默認的排序方式是升序，如果想改成降序，就加個-r就搞定了。

[rocrocket@rocrocket programming]$ cat number.txt
1
3
5
2
4
[rocrocket@rocrocket programming]$ sort number.txt
1
2
3
4
5
[rocrocket@rocrocket programming]$ sort -r number.txt
5
4
3
2
1
4 sort的-o選項

由于sort默認是把結(jié)果輸出到標準輸出，所以需要用重定向才能將結(jié)果寫入文件，形如sort filename > newfile。

但是，如果你想把排序結(jié)果輸出到原文件中，用重定向可就不行了。

[rocrocket@rocrocket programming]$ sort -r number.txt > number.txt
[rocrocket@rocrocket programming]$ cat number.txt
[rocrocket@rocrocket programming]$
看，竟然將number清空了。

就在這個時候，-o選項出現(xiàn)了，它成功的解決了這個問題，讓你放心的將結(jié)果寫入原文件。這或許也是-o比重定向的唯一優(yōu)勢所在。

[rocrocket@rocrocket programming]$ cat number.txt
1
3
5
2
4
[rocrocket@rocrocket programming]$ sort -r number.txt -o number.txt
[rocrocket@rocrocket programming]$ cat number.txt
5
4
3
2
1

5 sort的-n選項

你有沒有遇到過10比2小的情況。我反正遇到過。出現(xiàn)這種情況是由于排序程序?qū)⑦@些數(shù)字按字符來排序了，排序程序會先比較1和2，顯然1小，所以就將10放在2前面嘍。這也是sort的一貫作風。

我們?nèi)绻敫淖冞@種現(xiàn)狀，就要使用-n選項，來告訴sort，“要以數(shù)值來排序”！

[rocrocket@rocrocket programming]$ cat number.txt
1
10
19
11
2
5
[rocrocket@rocrocket programming]$ sort number.txt
1
10
11
19
2
5
[rocrocket@rocrocket programming]$ sort -n number.txt
1
2
5
10
11
19

6 sort的-t選項和-k選項

如果有一個文件的內(nèi)容是這樣：

[rocrocket@rocrocket programming]$ cat facebook.txt
banana:30:5.5
apple:10:2.5
pear:90:2.3
orange:20:3.4

這個文件有三列，列與列之間用冒號隔開了，第一列表示水果類型，第二列表示水果數(shù)量，第三列表示水果價格。

那么我想以水果數(shù)量來排序，也就是以第二列來排序，如何利用sort實現(xiàn)？

幸好，sort提供了-t選項，后面可以設(shè)定間隔符。（是不是想起了cut和paste的-d選項，共鳴～～）

指定了間隔符之后，就可以用-k來指定列數(shù)了。

[rocrocket@rocrocket programming]$ sort -n -k 2 -t : facebook.txt
apple:10:2.5
orange:20:3.4
banana:30:5.5
pear:90:2.3

我們使用冒號作為間隔符，并針對第二列來進行數(shù)值升序排序，結(jié)果很令人滿意。

7 其他的sort常用選項

-f會將小寫字母都轉(zhuǎn)換為大寫字母來進行比較，亦即忽略大小寫

-c會檢查文件是否已排好序，如果亂序，則輸出第一個亂序的行的相關(guān)信息，最后返回1

-C會檢查文件是否已排好序，如果亂序，不輸出內(nèi)容，僅返回1

-M會以月份來排序，比如JAN小于FEB等等

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